Principe de Base 1
On focalise un Laser sur une partie de l’échantillon. Celui ci, ayant des propriétés de fluorescence va réémettre dans une autre longueur d’onde que l’on pourra détecter à l’aide d’un photo détecteur à avalanche (ou un utilisant un SPCM). L’astuce des microscope confocale par rapport à un microscope à fluorescence traditionnel est d’appliqué un filtre spatiale, pour bloqué les rayons émis par une partie de l’échantillon qui n’est pas focus.